高质量油菜基因组图谱发布

油菜基因组的高质量定位:华中农业大学

最近，自然植物在线发布了8个甘蓝型油菜品种(材料)的优质参考基因组。华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室油菜课题组和生物信息组在此基础上分析了油菜生态型分化的遗传和分子基础。该研究为进一步分析甘蓝型油菜基因组结构和加快油菜品种改良提供了重要资源，对重要农艺性状的基因定位和克隆具有重要意义。

油菜是世界第三大油料作物，提供世界13-16%的食用植物油。大约7500年前，甘蓝型油菜，一种卷心菜和卷心菜的天然杂种，出现在地中海地区。甘蓝型油菜自20世纪传入中国、澳大利亚和北美后，经过自然选择和人工选择，发生了适应性变化，逐渐形成了三种不同的生态型(冬油菜、半冬油菜和春油菜)。

油菜是一种具有复杂基因组的异四倍体作物。已发表的油菜参考基因组的质量和代表性不足以满足油菜功能基因组学研究和遗传改良的需要。因此，本研究通过整合数据，对8个有代表性的甘蓝型油菜基因组进行了组装和注释。其中，ZS11基因组长度超过3.1Mb，是目前最完整的油菜参考基因组。

为了让研究人员更方便地利用多个基因组，本研究首次建立了以共线性直向同源基因为纽带的油菜种内指数基因指数。通过比较基因组学方法，绘制了8个基因组的综合变异图，这些变异对油菜中至少9.4%的编码基因有很大影响。油菜全基因组和核心基因组框架为功能基因研究和遗传育种提供了新的重要资源。

相关论文信息:http://doi.org/10.1038/s41477-019-0577-7