科学家首次绘就水稻泛基因组图谱

上海，1月16日(记者黄鑫)——中国科学院植物生理生态研究所分子植物科学研究中心与上海师范大学生命与环境科学学院黄团队合作，首次绘制了栽培稻-野生稻的泛基因组图谱，并系统地鉴定了覆盖所有水稻群体的编码基因集。今天，这项成就以一篇长文的形式发表在《自然遗传学》杂志的网络版上。

从野生稻驯化而来的水稻品种众多，分布广泛。除了整个亚洲，它们还少量分布在欧洲、美洲和澳大利亚。水稻可以适应各种生态和农艺条件。其丰富的遗传多样性在驯化和现代育种中发挥了重要作用，并将成为应对粮食需求增长和环境变化以及改良品种的关键资源。

据了解，20多年来，日本粳稻一直是水稻研究的模式材料。在以往的研究中，水稻基因组遗传变异的鉴定主要依赖于其序列与粳稻“日本晴”的相似性。然而，粳稻“日本晴”不能涵盖栽培稻和普通野生稻的所有功能基因。例如，水稻品种如“日本晴”完全没有耐涝基因和高效吸收磷肥的基因。

黄在接受《中国科学报》采访时表示，课题组从不同水稻群体中筛选出66个栽培稻品种和野生稻品系，通过深入测序、从头序列组装和基因注释分析，获得了各种水稻群体材料的精细基因组图谱，鉴定出水稻基因组中的各种复杂遗传变异，发现许多功能基因具有多重等位基因类型。此外，许多新鉴定的编码基因具有转录产物和蛋白质功能域，表明某些生物功能可能存在。

相关专家表示，这一成果将有助于准确发现复杂农艺性状的关键突变位点，大力推进水稻功能基因组学研究，帮助育种者充分利用各类水稻群体丰富的遗传变异，为进一步提高我国水稻的产量潜力和抗逆性提供重要的基础信息。

中国科学新闻(2018-01-17，第一版集锦)