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美模型生物学数据库陷经费困境

科普小知识2021-11-09 23:26:49
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该数据库包含模型生物信息,如果蝇。照片来源:stockstudioX/Getty

美国最近计划重组和削减由国家卫生研究院(NIH)支持的五个模型生物数据库的资金。这项提议遭到了研究人员的强烈反对。

由46名研究人员签署的公开信提到,这些数据库包含丰富的物种数据,如芽殖酵母、苍蝇、蛔虫、斑马鱼和老鼠,以促进生物和人类疾病的研究和发展。该数据库还包含模式生物的遗传和生物信息,如基因、蛋白质、基因表达和其他数据。此外,数据库还包括分析工具信息。

“在过去的20年里,国家卫生研究院对模型生物数据库的支持促进了一系列重要的发现。我们希望它能继续保持这一愿景,并支持重要的研究基础设施。”研究者在给美国国立卫生研究院院长弗朗西斯·柯林斯的信中提到。

今年5月,美国国家人类基因组研究所(NHGRI)的官员表示,该机构计划在明年初逐步削减上述数据库的资金30%~40%。在本财政年度,国家人类发展报告倡议为五个数据库拨款1760万美元。

据报道,国家卫生研究院正在从其他国家卫生研究院的研究机构寻求资金来帮助运行这些数据库。此外,在马里兰州举行的一次会议上,NHGRI官员要求数据库负责人在几个月内提交整合计划,以整合这些数据库的一些功能。在未来几年,该机构计划完全合并这些数据库。

“我知道研究界有很多担忧,但我们需要更广泛的支持来更好地构建数据库。目前,我们再也负担不起这份工作了。”NHGRI计算基因组学和数据科学项目的负责人瓦伦蒂娜·迪·弗朗切斯科说。她还说,独立操作每个数据库会让用户感到困惑。"用户应该能够用一个界面提取所有需要的数据."迪弗朗切斯科说。

然而,一些人表示反对。加州大学伯克利分校的发展生物学家大卫·比尔德指出,每个数据库都包含一些其他地方无法复制的特征。“我们不反对集成,但我们呼吁仔细考虑整个工作,以确保数据库的高质量和实用性。”他说。(张张)

《中国科学新闻》(国际,第三版,2016年6月30日)

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