入侵中国的草地贪夜蛾基因组序列首次发布
科普小知识2021-12-18 08:22:58
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入侵的斜纹夜蛾对有机磷和其他农药具有很高的抗性。基因组图
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所生态基因组中心与中国农业科学院植物保护研究所吴孔明院士团队等各方在BioRxiv预印服务器上联合发布了高质量的斜纹夜蛾基因组序列。这是首次从基因组水平揭示入侵中国的甜菜夜蛾种群的生物型遗传背景和抗药性特征,对科学防治甜菜夜蛾具有重要的指导意义。
本研究利用Illumina、PacBio、Hi-C等高通量测序技术,构建了一套染色体水平上的高质量的甜菜夜蛾基因组序列。重叠群N50达到了5.6 M,这是迄今为止组装得最好的甜菜夜蛾基因组序列。
该研究小组进一步对来自中国16个省(市、区)的105个样本进行了重新排序,揭示了入侵的斜纹夜蛾是由玉米类型的遗传背景所控制的“杂种类型”。
然而,抗性相关基因的扫描检测发现,入侵的中国人群对传统有机磷农药、有机氯农药和拟除虫菊酯类农药的抗性基因突变频率较高。然而,未检测到新酰胺类农药和Bt毒素抗性基因的突变位点,表明对相关传统农药的抗性风险较高。
研究表明,有机磷农药、有机氯农药和拟除虫菊酯等传统农药不适合目前我国对草地螟的防治,而酰胺类农药、Bt毒素和Bt作物能有效防治草地螟。
相关论文信息:https://doi.org/10.1101/813154