9月18日《自然》杂志精选

柠檬科鱼类基因组中适应性辐射的指标

在非洲裂谷的湖泊和河流中发现的大约2000种鱼类是适应性辐射的典型例子。这个大规模的国际合作项目已经对属于柠檬科的五种非洲鱼类的基因组和转录组进行了测序和分析，这五种鱼类属于不同的谱系。所获得的数据表明，与其他鱼类相比，它们的基因复制得太多了。有大量的非编码元件分化、加速的编码序列进化、与在直向同源基因对中插入转座因子相关的表达分化以及新的miRNA的调节。来自6个密切相关的维多利亚湖鱼类物种的60个个体的测序数据表明，与编码变异体和调节变异体的全基因组分化选择相关的鱼类的快速物种形成，还表明古代纯化选择的松弛期使得现有变异体的积累成为可能，这可能在促进分化中发挥重要作用。

结直肠肿瘤的蛋白质组/基因组研究

“临床蛋白质组肿瘤分析联盟”的一个研究小组现在已经分析了95种结肠和直肠肿瘤的蛋白质组，这些肿瘤以前被称为“癌症基因定位”项目。蛋白质组学数据和原始基因组数据的整合表明，从DNA或RNA水平测定的结果中不能可靠地预测蛋白质丰度，并且mRNA水平和蛋白质水平之间的相关程度不大。蛋白质组学研究已经确定了5种结直肠癌亚型，它们反映了已知的生物学特征，但也捕获了转录组水平上的微小差异。这种综合的“蛋白质基因组分析”可以为解释癌症生物学中的基因组异常提供一个功能背景。

人类“后提升情结”的结构

APC/C是一种大型E3连接酶，介导细胞周期调节蛋白的泛素依赖性蛋白水解，以控制复制和细胞分裂过程中的各种事件。在这项研究中，大卫·巴尔福德和他的同事们用低温电子显微镜测定了在由人APC/C及其共激活因子CDH1和基质HSL1形成的复合物中人APC/C的二级结构，分辨率为7.4。这一结构信息使研究人员能够确定所有20个亚基的位置和结构，也有助于理解CDH1如何刺激APC/C的泛素化活性

超小星系有超大质量黑洞。

天体M60-UCD1是已知最亮的“超小型矮星系”(UCD)和最大的UCD之一(约2亿个太阳质量)。Anil Seth等人使用自适应光学光谱学来研究M60-UCD1的动力学。他们在中心探测到了一个超大质量黑洞，其大小相当于2100万个太阳质量。M60-UCD1是已知质量最低的超大质量黑洞系统。作者认为它可能位于另一个更大星系的中心，后来被一个巨大的邻近星系通过潮汐作用分裂。他们的分析还表明M60-UCD1的恒星质量与其亮度一致。

撒哈拉沙漠比人们想象的要古老得多。

大多数证据证明现代撒哈拉沙漠是在300万到200万年前首次形成的，这与北半球大规模冰川作用的开始是一致的。这项研究表明撒哈拉沙漠形成得更早。张等人发现，特提斯海(现代地中海、黑海和里海的前身)的收缩削弱了非洲季风的向北延伸，导致大约700万年前撒哈拉沙漠的形成。对之前的判断进行如此巨大的修正，可能会导致在地质学、进化生物学和气候学等不同领域对撒哈拉进行新的研究。

黑猩猩天生具有攻击性。

对黑猩猩和倭黑猩猩(我们最亲近的亲属)的研究，在试图理解人类攻击性的进化过程中具有影响力。然而，近年来，这些研究的可靠性受到了“人类影响假说”支持者的质疑，他们认为黑猩猩的暴力行为主要是人类活动的结果。现在，对非洲不同地区黑猩猩和倭黑猩猩研究工作的元分析表明，黑猩猩之间的攻击是为了获取资源或交配对象而采取的适应性策略的正常和预期的产物，与人类的存在与否无关。

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中国科学新闻(2014-09-25，第二版国际)