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专家希望大数据能彻底改变癌症研究

科普小知识2021-08-10 16:28:17
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癌症研究人员对唐纳德·特朗普取代国家癌症研究所(NCI)主任哈罗德·瓦慕斯感到紧张。但在去年6月,他们的担心被证明是没有根据的,因为特朗普选择了诺曼“奈德”夏普勒斯来接管NCI。

51岁的夏普勒斯曾担任北卡罗来纳大学林伯杰综合癌症中心主任:他也是一名临床医生,创办了两家生物技术公司,并管理着一个致力于基础研究的实验室,致力于细胞分裂和衰老所必需的p16蛋白的研究。

夏普勒斯于去年10月上任,接管了NCI的重任。他花了两个月的时间来分析和了解这个拥有57亿美元资金的研究所的信息。例如,他与六名在世的NCI前董事、NCI外派人员和内部员工进行了交谈。

最近,在接受媒体采访时,夏普勒斯提到了他认为非常重要的三个领域:大数据、基础研究以及将发现转化为设备和治疗。他说,他一直在思考如何支持年轻研究人员的职业生涯,这也是NCI的母机构——国家卫生研究院(NIH)的一个长期问题。

IBM计划使用沃森超级计算机来指导癌症治疗,但这是有争议的。当被问及如何看待大数据时,夏普勒斯说,100%的人认为人工智能和机器学习将对癌症研究和癌症治疗产生巨大影响。”(在北卡罗来纳大学),我们使用沃森的计算机来组织新疗法的文献,这样分子肿瘤委员会就可以根据基因突变来决定给病人提供什么药物。关键是它就像一百万个助手,非常快,而且非常有用。”

夏普勒斯还提到,数据的提取和排序是最困难的部分。“对于学生来说,阅读图表和抽象的基因数据太慢了,所以这些自然语言处理和记录提取工具非常有用。这将为我们带来数百万患者的临床注释和基因组数据集,让我们能够做我们真正需要做的事情。”他说。

当被问及是否担心特朗普在2018财年大幅削减国家卫生研究院预算的计划时,夏普勒斯指出,他有义务支持总统的预算。此外,国会对国家卫生研究院预算的承诺是好的。在过去两年中,预算大幅增加,2018财年的预算最初看起来也很有希望。“我认为预算挑战是真实的。因为如果你考虑癌症的负担或社会成本,57亿美元是不够的。”

在资助年轻研究人员方面,夏普勒斯说,NCI一直在考虑为一些新的年轻研究人员设立长期研究基金。该机构将提出一个新的方案。如果获得批准,他们将获得两年的额外资金。"这个过程或多或少只是为了确保他们仍在取得进展。"(唐毅宸)