新冠病毒来源于穿山甲?尚无决定性证据
穿山甲目前是主要的怀疑对象,但是一系列的基因分析还没有找到确凿的证据。
资料来源:詹姆斯·奥布赖恩| quantamagazine.com
随着新冠状病毒在全球的传播,科学家们正在紧急确定新冠状病毒的来源。三周前,中国科学家根据基因分析指出,以蚂蚁为食的穿山甲是主要的怀疑对象。然而,在回顾了这项研究的数据和上周发表的另外三项穿山甲冠状病毒基因组研究后,科学家们认为,尽管穿山甲仍然非常可疑,但我们仍远未找到答案。
公共卫生官员希望尽快确定新冠状病毒的来源,以帮助他们预防新的疾病爆发。科学家认为,像其他冠状病毒一样,这种病原体通过动物传播给人类。例如,2002年的非典病毒被认为是通过灵猫传播给人类的。在疫情早期,几十人来自武汉的一个活禽市场。然而,在这个市场上发现的冠状病毒样本的检测还没有确定具体的来源。
三个不同的中国小组正在追踪新冠状病毒的来源,一个来自中国疾病预防控制中心,另一个来自中国科学院。
通信故障
在2月7日的新闻发布会上,来自华南农业大学的研究人员认为穿山甲是新冠状病毒的动物来源。穿山甲的肉和鳞片在中国很受欢迎,尤其是鳞片可以添加到传统药材中。穿山甲贸易在世界范围内被禁止,中国不允许出售穿山甲,但是仍然有穿山甲从一些东南亚和非洲国家走私到中国。华南农业大学的研究人员称,他们在走私的穿山甲鳞片中发现了一种冠状病毒,其与新的冠状病毒在人群中传播的基因匹配率达到99%。
然而,这个结果并不涉及整个基因组。这项研究于12月20日发表在生物医学预印本服务器bioRxiv上。作者说,分析实际上只针对一个特定的位点,即受体结合域(RBD)。华南农业大学的寄生虫学家肖丽华是该论文的合著者之一,他解释说,新闻发布会的报道源于“生物信息团队和研究实验团队之间令人尴尬的沟通错误”。与全基因组相比,穿山甲和该病毒在人体内的DNA相似度为90.3%。
受体结合域对冠状病毒至关重要,冠状病毒可以让冠状病毒抓住细胞并进入细胞。即使两种病毒的受体结合域有99%相似,也不足以解释两者之间的联系。据新加坡杜克大学医学院的病毒学家王林发称,王林发也是发现非典病毒来源的团队成员之一。
相似性是不够的
上周,三项类似的对照研究也在bioRxiv上发表。2月18日发布的一篇论文来自一个国际研究团队。他们发现2。从冷冻细胞样本中非法走私的穿山甲鳞片中提取的冠状病毒与人体内该病毒的DNA相似度为85.5%-92.4%。
2月20日发布的另外两篇论文来自中国团队,他们也研究了走私穿山甲鳞片中的冠状病毒。所研究的病毒与COVID-19致病病毒的相似性分别为90.23%3和91.02%4。
加拿大麦克马斯特大学的冠状病毒研究员阿林杰·班纳吉(Arinjay Banerjee)表示,为了识别宿主,基因相似性需要高于从这些研究中获得的数字。他指出,非典病毒与麝香猫的冠状病毒基因组有99.8%的相似性,这就是为什么麝香猫被认为是非典病毒的动物来源。Banerjee说,如果穿山甲真的是暴发的动物来源,那么在这些研究中它们不是穿山甲。
主要差异
迄今为止,与人类冠状病毒匹配度最高的蝙蝠来自中国云南省的一只蝙蝠。2月3日公布的一项研究发现,这种蝙蝠冠状病毒和COVID-19致病病毒的遗传物质相似性为96%。蝙蝠将病毒直接传播给人类并不是不可能的,但是这两种病毒的受体结合域位点有着重要的区别。研究人员认为,这种差异表明这种特定的蝙蝠冠状病毒不会直接感染人类,但可能通过中间宿主传播给人类。
中国科学院动物研究所的生态学家蒋志刚说,这些论文回答了一些问题,但也提出了更多问题。他问,如果穿山甲是新冠状病毒的来源,而且它们来自其他国家,为什么来源中没有人报告感染?
武汉江汉大学动物行为研究员萨拉·普拉托担心,所有关于穿山甲是新冠状病毒来源的猜测都可能导致穿山甲的死亡。非典爆发后,果子狸大量死亡。"问题不在于动物,而在于我们与它们的接触."普拉特说。
参考:
1.肖,郭克明等.生物四号预印本(2020).
2.林天佑等。https://doi.org/10.1101/2020.02.13.945485生物制品展预印本(2020)。
3.刘,李平,等. bioRxiv预印本(2020).
4.张婷,吴,张青,张.生物四号预印本(2020).
5.周,等自然(2020)。
原始链接:
https://www.nature.com/articles/d41586-020-00548-w
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