最大家谱揭示环境对寿命影响
6000人的家谱已经被清理干净,并用图论进行了分类。资料来源:哥伦比亚大学
今年,你忘了你妈妈的生日了吗?振作起来:你的家谱现在可能包括1300万个生日。
纽约哥伦比亚大学的计算生物学家亚尼夫·埃尔里奇(Yaniv Erlich)和他的同事利用众包数据创建了一个将1300万人联系在一起的谱系。这张祖先图被认为是同类中最大的已验证资源——平均跨越10代。
研究人员在3月1日的《科学》杂志上报道了这一结果。
埃尔里奇的团队分析了这一家族成员的出生和死亡日期,并计算了如果他们有血缘关系,个人的死亡年龄是否相似。研究小组得出结论,遗传因素只能解释这些个体16%的预期寿命差异。大部分差异可以归因于其他因素,如人们的生活方式和他们住在哪里。
巴尔的摩马里兰大学医学院的遗传流行病学家布拉克斯顿·米切尔说:“这是一次真正的旅行。”“这是一个利用大型开放数据集进行有趣研究的好例子,”他说。
科学家们一直怀疑环境对人类寿命的影响比基因更大。但是,埃尔里奇估计,基因不如研究人员先前认为的那么有效。
一些研究,例如米切尔研究小组在2001年发表的一项成果,估计基因决定了人类预期寿命变化的四分之一。
盐湖城犹他大学医学院的遗传学家丽莎·坎农·奥尔布赖特说,埃尔里奇的发现证明了家谱的力量。
奥尔布赖特说:“这些资源将是未来基因研究的一个强大领域。”
埃尔里奇指出,“好”基因可能会延长一个人的平均寿命5年。然而,一些环境因素会对寿命产生更大的影响。例如,吸烟会使寿命缩短10年。
遗传学家长期以来一直使用系谱学来研究基因对许多性状的影响,例如疾病风险。然而,建立一个由包含大量人口的家庭文件组成的数据库是一项昂贵而费力的任务。埃尔里奇团队的研究是目前正在进行的将数字记录收集到非常大的家谱中的许多方法之一。一些方法已经证实基因与癌症和阿尔茨海默病等疾病有关。
埃尔里奇的研究使用了在线家谱工具Geni.com的数据。他是Geni的母公司,位于耶胡达的MyHeritage的首席科学官。
该分析基于Geni用户上传的约8600万人的数据。这比最大的消费者基因测试数据库的参与者数量要高一个数量级。
旧金山加利福尼亚大学的计算基因组学科学家阿图尔·布特说:“参与者的绝对数量是疯狂的。”他说:“你只能通过众包获得这样的数据集。这真是令人印象深刻。”
埃尔里奇的团队使用这些数据来分析Geni列表中参与者的迁移和婚姻模式。例如,研究人员发现,在1750年之前,数据库中的大多数美国人和欧洲人结婚的地方离他们的出生地有10公里远。到1950年,大多数美国人和欧洲人必须从他们的家乡旅行至少100公里才能找到配偶。
换句话说,你的父母可能比他们的祖先走得更远来建立你的家庭。至少你应该记得他们的生日。(赵茜·Xi)
中国科学新闻(2018-03-07第二版国际版)