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科学家大规模破译人体组织的基因活性

科普小知识2021-08-26 11:25:47
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最近,《自然》和《自然遗传学》发表的一系列论文全面介绍了人体不同组织和个体中基因表达的差异。这些发现为理解健康组织中基因变异和基因表达之间的相关性带来了新的启示,并有望揭示疾病分子起源的新线索。

人类基因组编码指令来调节基因表达。基因表达因细胞类型而异,导致不同的组织具有不同的功能。它们在不同的个体中也是不同的。驱动这些差异的序列通常位于基因组的非编码区,它们决定了基因表达的模式和时间。然而,对不同人类组织和个体的基因调控和基因表达差异的研究仍然有限。

基因型-组织表达研究联盟收集并研究了来自449名健康人体供体的7000多份尸检样本,涵盖44个组织(42种不同的组织类型),包括31个实体器官组织、10个大脑区域、全血以及来自供体血液和皮肤的两个细胞系。研究人员利用这些样本来研究不同组织和个体中基因表达的差异。在他们的《自然》论文中,他们报告说他们已经采用了数量性状基因座(eQTL)的作图方法,表明大多数人类基因受到局部变异的影响,并且变异序列接近受影响的基因。他们还鉴定了93个基因,这些基因的表达受远距离变异的影响,包括不同染色体上的变异。

在本期《自然》杂志中,另一篇论文研究了基因表达中罕见突变的作用。两篇论文使用GTEx数据来探索与基因表达相关的基因突变如何调节核糖核酸编辑和X染色体失活。在《自然遗传学》发表的一篇相关评论中,研究人员介绍了增强GTEx项目,该项目是GTEx项目的延伸,为研究遗传差异如何通过分子表型逐步影响人类健康提供了资源。

综上所述,这些发现强调了来自不同个体和不同组织的数据在识别人类疾病相关突变背后的基因和机制方面的价值。伊利诺伊州芝加哥大学的Yoav Gilad和其他人在相应的新闻和评论文章中写道:“各方都做出了一致努力,以克服大规模获取人类死后样本的道德、法律和技术挑战。”。“GTEx研究联盟生成的大量数据使我们在破译基因组调控密码方面向前迈进了一步。基因变异对基因表达的影响正在逐渐变得清晰。”(张张)