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中科院昆明动物所开发出精神分裂症遗传研究数据库

科普小知识2021-10-20 01:51:21
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最近,中科院昆明动物研究所罗课题组和姚永刚课题组开发并构建了精神分裂症基因数据库SZDB。研究结果发表在《精神分裂症公报》上。

精神分裂症的病因尚不清楚,但遗传和环境因素在精神分裂症的发生中起着重要作用。研究者开发和构建的精神分裂症遗传数据库SZDB收集了大量与精神分裂症相关的数据,包括遗传研究数据、基因表达数据、网络数据、脑eQTL数据、SNP功能注释数据等。通过在不同水平上整合和分析这些数据,可以识别精神分裂症的一些重要候选基因。

SZDB主要包括三个模块:(1)搜索模块,主要完成一些常规的检索工作,如单核苷酸检索和基因检索;(2)分析和工具模块,可以实现共表达分析、蛋白质相互作用网络分析、eQTL分析等分析功能。(3)基因模块,包括与精神分裂症相关的各种数据,包括GWAS数据、拷贝数变异数据、连锁分析数据等。与该领域现有的数据库不同,SZDB引入了个性化分析模块(分析与工具),用户可以通过该模块进行一些个性化分析(如eQTL、蛋白质相互作用、共表达等)。)。