白木香基因组精细图谱发布

白木香的形态特征

白木香与其他物种的比较基因组学分析

近日，中国热带农业科学院热带生物技术研究所和中国农业科学院深圳农业基因组研究所崔鹏团队联合发布了白木香详细基因组图谱。相关的研究结果已经发表在GigaScience杂志上。基因组精细图谱的发布将为野生白木香种群的保护生物学、白木香香气形成机制、香气基因和树种的进化研究奠定良好的基础，也为白木香的进一步基于基因组的分子育种提供了可能，在基础研究和应用领域具有重要意义。

白木香是传统名贵药材和天然香料“白木香”的重要来源植物，主要分布在我国南方的热带和亚热带地区。在自然条件下，只有7%~10%的白木香具有芳香，而且形成过程极其缓慢，通常需要几十年的时间。良好的药用价值和巨大的经济效益导致了白木香的掠夺性采伐，其野生资源逐渐枯竭。野生白木香是国家二级保护植物，在《中国生物多样性红皮书》(高等植物卷)和《国际自然保护联盟红皮书》中被列为脆弱物种(VU)，并被列入《濒危物种公约》附录2。

该研究团队使用牛津纳米孔和Illumina测序并结合高-C数据生成220.61千兆字节的高质量读取长度。组装后的白木香基因组大小约为726.5Mb，其中716.6Mb序列锚定在8条染色体上，支架N50为88.78Mb，BUSCO分析结果为95.2%。重复序列占基因组的59.13%，29203个蛋白质编码基因被注释。根据单拷贝基因的系统发育和分化时间的估计，发现白木香与其最接近的共同祖先大约在5318 ~ 8437万年前分离。

白木香是瑞香科第一个基因组组装到染色体水平的物种。随着后期更多个性化数据的组装和分析，新的基因组图谱将不断更新。

近年来，海南省*高度重视沉香产业。为全面推进海南省沉香产业发展，海南省*先后出台了《沉香产业发展规划(2018-2025年)》和《促进海南省沉香产业创新发展工作规划》。*提出了规范沉香科学培育、提高科技创新能力、促进产业优质发展、完善市场建设的明确任务，并提出逐步将海南省建设成为世界优质沉香原料基地、全国最大的深加工生产基地和贸易中心。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/gigascience/giaa013