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德科学家获五角大楼DNA分析比赛冠军

科普小知识2022-07-10 14:08:02
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由生物信息学科学家丹尼尔·侯赛因领导的团队获得了100万美元的奖金。来源:迈克·斯蒂尔

由美国国防部发起的DNA分析挑战比预期的更难,但赢家已经出现。上周,国防部宣布,侯赛因将获得100万美元的奖金,用于其快速DNA分析计算机程序。今年早些时候,当103名参赛者中只有3名进入决赛时,比赛的设计和评分系统遭到了一些*参赛者的严厉批评。

来自德国图宾根大学的生物信息学专家丹尼尔·胡森(Daniel Huson)的团队进入了决赛,他说他和他的队友对夺冠的可能性有“良好的感觉”。他们很兴奋地发现自己的感觉是对的。

该竞赛正式命名为国防威胁减少局(DTRA)算法挑战,试图找到一种更好的方法来识别组织和基因的DNA样本,以确定可能的生物*威胁。这项挑战对任何人开放,参与者通过在线竞赛主持人提交他们的作品。胡森说他喜欢赢得比赛所需的疯狂和不间断的工作:“唯一像这样的工作是我在瑟瑞拉遗传学研究所研究人类基因组的时候。”

在比赛中,参与者需要在9组基因数据中获得一个准确的及格分数。一些人对DTRA的模糊评分算法表示不满,认为他们必须开发程序来满足一些不明确的要求。

事实证明,任务太难了,DTRA不得不延长最后期限,放宽要求。此时,胡森和他的两个同事,环境生命科学工程中心的生物信息学科学家谢超和*大学的计算机科学研究生本杰明·布克芬克开始组建团队参加比赛。

"计分方法非常微妙。"胡森承认,“确实有一些惊喜。”然而,他说他的团队已经能够通过尝试许多不同的方法稳步发展。(张冬冬)

《中国科学日报》(第三版国际版,2013年9月30日)