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疑似病例完成新冠病毒全基因组分析仅需半小时

科普小知识2022-07-10 18:39:54
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目前,新型冠状病毒的主要检测技术包括免疫、聚合酶链反应和高通量测序(NGS),其中免疫和聚合酶链反应方法是一种定向检测,可以筛选病毒,适用于诊断患者标本中是否存在病毒。

高通量测序作为一种全面的基因组检测技术,可以有效防止未检测到的病毒突变,但由于实验过程长,操作复杂,尤其是数据库建设步骤复杂,需要多次移液和移液操作,限制了其推广应用。

在此基础上,杰毅生物、浙江省疾病预防控制中心和阿里达摩医院的医学人工智能团队共同开发了中国第一台全自动宏基因组数据库构建设备——立方体。据报道,该平台是一种全基因组检测技术,不同于核酸检测方法。借助人工智能算法对基因数据的海量分析和处理能力,可以对疑似病例的病毒样本进行全基因组序列分析和比较。同时配备了基于CNAD技术(CRISPR等温检测法)独立开发的新型冠状病毒试剂盒。另外,该检测试剂盒不依赖于聚合酶链反应仪器,能够快速有效地解决医院单位的现场反应要求,从而快速发现病原体并进行感染诊断。

但是,由于全基因组检测技术是比较疑似病例病毒样本的全基因组序列,每个测序过程都会产生大量的数据,其预处理和数据分析非常耗时费力。为此,在阿里达摩研究所人工智能算法的支持下,该平台还在序列比对过程中对算法进行了分布式设计。

据了解,与传统的新冠状病毒分析检测相比,该平台可以节省至少8小时的分析检测时间,并且可以在半小时内完成对疑似病例的新冠状病毒全基因组分析,从而快速准确地捕获突变病毒序列、二级结构和三维结构,进而准确检测出突变病毒,大大提高了疑似病例的诊断速度。