中科院*理化所提出预测蛋白质相互作用的方法

(记者彭克峰)日前，在中科院*物理化学研究所研究员尤、的指导下，提出了一种利用蛋白质序列信息预测蛋白质相互作用的计算方法。相关结果发表在《国际分子科学杂志》上。

随着蛋白质相互作用实验技术的发展，人们可以获得大量的蛋白质相互作用数据，甚至可以分析整个基因组中的蛋白质相互作用。然而，由于实验技术的限制，许多高通量实验方法测得的蛋白质相互作用数据的误差率相对较高。另外，传统的实验方法不适合检测大规模数据。

为了获得重要的蛋白质信息，研究人员首先使用位置评分矩阵(PSSM)来表示每个蛋白质序列。研究发现，评分矩阵的表示方法不仅保留了序列的位置信息，还保留了蛋白质的化学信息。同时，为了开发PCVMZM预测模型，研究者首先从不同尺度的PSSM评分矩阵中提取准确的、有代表性的蛋白质信息，并将每一个信息表示为一个特征向量作为特征，使用一个强分类器来预测蛋白质的相互作用。

研究结果表明，该方法能够提供准确、稳定、高覆盖率的预测信息，为基因组研究提供了一个有用的决策工具。

《中国科学日报》(2017-08-01第4版综合)