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癌症研究人员联手汇集肿瘤基因组数据

科普小知识2022-07-12 13:52:16
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研究人员希望数据共享将带来更好的方法来利用肿瘤的基因组信息,例如这些脑癌细胞。

资料来源:罗伯特·考伊/视觉模拟有限公司。

这是大型癌症研究中心的许多病人的最新希望:“让我们对你的肿瘤进行排序,也许我们可以用战胜这种恶性疾病的药物来匹配它。”然而,现实是基因组分析仍然只为癌症患者提供了一小部分帮助。“大多数时候,我们不知道如何处理这些信息。”美国纽约州斯隆凯特林癌症中心的研究员查尔斯·索耶斯说。

今天,美国和欧洲的一些大型医学科学研究中心希望通过汇编患者肿瘤基因组及其临床结果的数据来改变这一切。最近,美国癌症研究协会(AACR)在波士顿举行的一次会议上宣布了这一计划。它的名字叫GENIE,是一个非常委婉的首字母缩略词,分别代表基因组、证据、肿瘤形成、信息和交流。该计划由索耶斯领导,他帮助开发了抗白血病药物格列卫。格列卫是最成功的基因靶向疗法之一。

索耶斯说,GENIE源自与其他癌症中心同事的对话。他们正在以“不可思议”的速度积累肿瘤基因数据。到目前为止,已有七个研究中心加入,包括MSKCC、波士顿的达纳-费伯癌症研究所、巴尔的摩的约翰·霍普金斯大学以及加拿大和欧洲的三个机构。AACR提供了200万美元,用于在两年试点阶段协调和存储数据。

这些中心通常为癌症已经扩散的晚期癌症患者提供排序。一般来说,它们不会对整个肿瘤基因组进行测序。相反,测序是一系列已知的癌症基因,如BRAF和EGFR,前者通常在黑色素瘤中发生突变,后者导致许多肺部肿瘤的生长。随后,测序报告通常被提交给专家委员会,由专家委员会决定它们是否指向特定的疗法。然而,尽管BRAF和EGFR突变可以被药物靶向,但肿瘤通常只包含罕见的突变,其在癌症中的作用尚未被完全理解。

GENIE将使研究人员能够分享这些罕见的治疗案例,并获得得出明确结论所需的数据。该项目还将揭示影响患者预后的突变。(慢慢地)

中国科学新闻(2015-110第三版国际版)

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