香港理工研发大数据分析平台揭示癌症基因关系
新华社香港6月23日电(记者谢希玉)记者23日从香港理工大学获悉,该大学在癌症基因组大数据分析方面取得了重大突破。通过建立创新的大数据分析平台,分析基因之间的相互作用,揭示基因网络在癌症中的失控机制。
这项突破是由香港理工大学医学科技及资讯科学系教授翁益铭、陈颖芝及黄思泉,以及哈佛大学生物统计专家组成的研究小组的成果。
该研究小组还发现了一种用于诊断和治疗慢性髓细胞白血病的潜在靶基因,即NPM1及其相关基因。相关研究结果有助于建立以NPP为导向的治疗策略,使靶向治疗能够更准确地针对问题,对症下药。同时,该分析平台也可广泛应用于其他疾病。
据介绍,传统的癌症基因研究方法是比较癌症患者和健康人的全基因组,找出具有显著差异的个体基因。这种方法已经使用了很长时间,不能找出基因的相互作用及其系统变化,进而了解癌症的发病机制。
在这项研究中,研究小组假设参与相同机制的基因会表现出共同的表达(即基因之间的表达水平是相互关联的),并探索每对基因之间的关系,从而破解癌症背后的机制。基因对组合的数量随着基因的数量呈几何级数增长,而人类基因组有超过20,000个蛋白质编码基因,因此基因共表达的分析涉及约2亿对基因。
哈佛大学的生物统计学专家帮助研究小组进行了大规模的计算机模拟实验,并建立了癌症基因共同表达的统计方法。该研究团队克服了处理大量数据的挑战,只用了两天时间就分析了两亿个基因对的共同表达,突破了传统方法的不可能性,建立了前所未有的科学基础。
本研究为结构基因共表达分析建立了一个创新平台,以揭示癌症的发病机制,并开发面向NPP的治疗策略。合作绩效分析发现了基因网络上的失控机制,加深了对癌症生物学的理解,并有助于确定新的治疗方向。该平台不仅有助于科学发展,而且可以随时应用于其他疾病的诊断、预后和治疗。(原标题:香港理工大学开发大数据分析平台揭示癌症基因关系)