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癌症再现项目发布首批结果

科普小知识2022-03-12 23:13:39
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资料来源:斯坦利·弗莱格勒

今年,美国加利福尼亚州拉霍亚市斯坦福博汉医学研究所(SBP)的癌症生物学家埃尔基·罗斯拉蒂已经开始了一项针对癌症患者的药物试验,该试验正在进行中,但该试验现在可能处于危险之中。原因是一个雄心勃勃的开放科学项目发布了第一批结论,而鲁奥斯拉蒂不幸被列入了黑名单。

这个再现性项目旨在测试重要的癌症生物学成就是否能在独立的实验室中再现。最近,该项目指出,对于第一阶段的5篇高知名度癌症研究文章,经过严格按照原研究的实验方案反复验证,发现Ruoslahti研究根本无法重复,其他4篇结果不确定。

根据该项目,癌症生物学领域一些高影响力癌症研究文章的可重复性非常差。然而,该项目所针对的几乎所有科学家都说,癌症生物学像许多其他领域一样,经常被证明无法复制,其原因包括,例如,有问题的试剂、变化无常的生物系统等。

鲁奥斯拉蒂质疑这一裁决。毕竟,至少有来自美国、欧洲、中国、韩国和日本的10家实验室在2010年的一篇论文中证实了他的观点,该论文首次报道了一种肽的药用价值,这种肽能够穿透肿瘤并增强其他化疗药物杀死肿瘤的能力。“也许在我的实验室里,已经有三代博士后在这个问题上欺骗了自己。其他人都在犯同样的错误吗?我简直不敢相信。”他说。

弗吉尼亚州夏洛茨维尔科学开放中心再现性项目主任Tim Errington指出,事实上,不能重复一次实验结果并不能证明最初的结论是错误的,也不应该玷污一个人的论文。艾灵顿提到,调查人员可以利用这些结论作为信息,但不能“定罪”。

然而,鲁奥斯拉蒂担心,该项目未能复制其研究结果,将阻碍他从药品研发中心获得资金。“这肯定会有影响。我只是不知道有多严重。”他说。

该项目名为癌症生物学中的重复工程,由科学开放中心和科学实验外包平台于2013年联合发起。其目的是选取2010-2012年发表在《科学》、《自然》、《细胞》等*期刊上的50篇高影响力肿瘤生物学相关研究论文,进一步验证这些论文的可重复性。

建立该项目的主要原因是,生物技术巨头安进的研究人员发现,在试图追踪发表在数十篇论文中的新药的潜在治疗效果时,53篇重要癌症论文中的47篇不能被复制。然而,由于这些生物公司已经与相关实验室签署了保密协议,他们没有透露相关的文章和细节,因此他们不能重复实验。

相比之下,癌症生物学领域的重复项目将公布所有的结论,从而给鲁奥斯拉蒂带来不小的麻烦。然而,由于财政问题和难以获得信息材料,论文数量已从50篇减少到29篇。然而,所选论文无一例外地显示出非常差的可重复性,并且在eLife上发表的五项研究只是第一批。

正是这五篇论文给癌症生物学领域投下了阴影。eLife的高级编辑西恩·莫里森指出,重复鲁奥斯拉蒂的研究是一个彻底的失败。另外两篇文章产生了无法解释的结果,最后只有两篇可以大致重复。

据报道,可以重复的两篇论文是斯坦福计算生物学家阿图尔·布特实验室的一篇论文,该论文证明了一种溃疡药物西咪替丁可以减缓小鼠肺部肿瘤的生长,以及一篇论文指出BET溴域,一种癌症基因Myc抑制剂,可以延缓小鼠多发性骨髓瘤的生长,并且该抑制剂也已经进入临床试验。

产生不确定结果的论文分别是达纳法伯癌症研究所肿瘤生物学家利瓦伊·加拉维团队的报告,该报告指出PREX2基因突变后将刺激黑色素瘤生长,斯坦福大学干细胞生物学家勒文·魏斯曼指出的针对肿瘤细胞表面受体的抗体CD47可减轻小鼠的肿瘤生长。

完全失败的Ruoslahti研究认为,肽分子iRGD可以帮助化疗药物渗透到前列腺肿瘤细胞并减少肿瘤体积。然而,反复研究发现,胰岛素样生长因子对小鼠没有这种作用。

然而,Ruoslahti认为这是因为在重复性研究中使用了商业iRGD,并且在证实其对肿瘤的作用之前,其活性未得到证实。然而,Errington答复说,之所以使用商业iRGD,是因为Ruoslahti拒绝提供文章中使用的iRGD。

无论如何,一旦结果公布,一些人欢迎再现性项目,而另一些人担心该项目不公平,会影响他们自己的研究。

"魔鬼藏在细节中。"埃灵顿说,尽管这些结论被质疑了无数次,但最清楚的结果无疑是,许多论文包含的研究方法细节太少。重复的团队需要花几个小时与原始作者沟通,以确定测试术语和试剂。之所以如此耗时,部分原因是这些内容通常由离开实验室的实验室学生和博士后负责。

埃灵顿也承认技术问题阻碍了研究的复制,但是这些有价值的数据决定了为什么独立研究者通常不能复制公开发表的研究结果。"发现弱点可以帮助科学家改进更好的实验设计,更有效地开展研究."

然而,这五篇文章只是这个项目的开始。(唐毅宸编译)

《中国科学日报》(2017-02-07第三版国际版)

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