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科学家对发表论文时间越来越长深感不满

科普小知识2021-11-02 05:28:38
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这个过程花了他们一生很长时间,阻碍了工作、补助金和终身职位的申请,并减缓了研究成果的传播。

照片来源:马特·墨菲

当丹妮尔·弗雷泽第一次提交论文并等待发表时,她完全没有意识到即将到来的痛苦经历。

弗雷泽花了大约18个月的时间研究在过去3600万年间遍布北美的数千个化石标本。现在,她得到了一个有趣的结果:在温暖潮湿的气候中,动物种群在不同的纬度分布最广。这项工作对弗雷泽在加拿大卡尔顿大学的博士学位至关重要,它可以用来预测哺乳动物对气候变化的反应,这是当前生态学研究中的一个关键问题。因此,在导师的鼓励下,她于2012年10月将结果提交给了《科学》杂志。

十天之后,论文被驳回。弗雷泽还把它贡献给了另一个著名的杂志,国家科学院学报。结果,论文再次被拒绝。接下来,她试图投票给生态快车,但是报纸被退回来了。“当时,我非常失望。这份文件甚至还没有经过审查,我想知道如何改进它。”

2013年5月,弗雷泽将他的论文提交给了他所在领域极具影响力的期刊《英国皇家学会学报》。在弗雷泽首次将其提交给《科学》杂志七个月后,该杂志将该论文送去审阅。“终于成功了!”弗雷泽想。然而,她不知道的是,她只是在漫长而坎坷的出版道路上迈出了第一步:在论文最终出版之前,她经历了三次提交、两次拒绝、两次重大修改和无数草稿。当论文发表时,弗雷泽几乎不想再看一遍。

弗雷泽的沮丧是共有的:研究人员不断质疑公布结果所花费的时间。许多人说,他们觉得自己陷入了一个提交、拒绝、审查、再审查、再审查的循环之中。这个过程花了他们一生很长时间,阻碍了工作、补助金和终身职位的申请,并减缓了研究成果的传播。2012年,纽约洛克菲勒大学的神经学家莱斯利·沃斯哈尔写了一篇评论文章,对科学出版的“缓慢”表示惋惜。“如果说过去三年有什么不同的话,那就是情况变得更糟了。”沃斯说。

同行审查

争论的一点是当前的评论家要求更多。当旧金山加利福尼亚大学的细胞生物学家罗恩·维尔分析1984年前六个月发表在《细胞》、《自然》和《细胞生物学杂志》上的生物论文,并将它们与2014年前六个月发表在这三份杂志上的论文进行比较时,他发现实验数据中作者的平均数量和研究小组的数量增加了2-4倍。淡水河谷认为,这表明发表一篇论文所需的数据量正在增加。他怀疑大部分增加的数据来自试图满足评论者要求的作者。科学家们对这些过分热心的批评者怨声载道,因为后者似乎总是想通过更多或不同的实验来揭示某种观点。然而,英国华威大学的细胞生物学家斯蒂芬·罗伊尔分析了他的团队发表论文所需的时间,发现在平均9个月的酝酿期内,将近4个月的时间用来修改论文并重新提交。

许多科学家也指责期刊编辑。他们认为,当评论意见不一时,编辑不愿意向论文作者提供明确的指导和决定,从而不必要地延长了审查和修订过程。期刊*不同意这种说法,并表示他们的编辑非常擅长处理混合评论。细胞杂志的主编艾米莉·马库斯说,他们的期刊编辑负责决定论文的出版,并将帮助作者制定修改计划。

马库斯还表示,《细胞》杂志正试图通过增加只经过一轮修订的论文数量来减少评论时间。2015年,《细胞》杂志发表的论文中有14%是这样做的。

《自然》杂志的编辑主任Ritu Dhand说,《自然》杂志的编辑们也发现现在越来越难找到评论者了。"可能是因为有太多的论文要复习."

加州大学旧金山分校计算生物学研究生丹尼尔·希姆斯坦(Daniel Himmelstein)发现,从2000年到2015年,PubMed数据库中的论文数量增加了两倍多,目前已接近100万篇。

技术进步

数字出版可能有利于缩短“生产”时间——从收到到出版的时间——而不是审查时间。根据希姆斯坦的分析,自本世纪初以来,纸张生产的时间减少了一半,稳定在平均25天。

一些新的期刊和在线出版平台承诺进一步加快出版进程。PeerJ于2013年推出,是目前鼓励开放同行评议的几个期刊之一。这些期刊的审稿人的姓名和评论与文章一起发布。希望增加透明度将防止不必要的延误或审查人员的大量修改要求。

生物医学和生命科学杂志《生命科学》于2012*,承诺编辑将做出初步决定,并在几天内快速审阅论文。审查者已经得到严格的指示,不要建议“完美的测试”,只有当附加的分析能在两个月内完成时,他们才能提出要求。否则,论文将被拒绝。加州大学伯克利分校的细胞生物学家、《生命》杂志主编兰迪·谢克曼说,这些政策意味着该杂志收到的论文中,超过三分之二只经过了一轮审查。

在2015年的一项分析中,希姆斯坦根据3482份期刊的平均评论时间创建了一个排名。从2014年1月到2015年7月,这些期刊在PubMed数据库中有带有时间戳的论文。分析发现,PeerJ的审核速度相对较快:审核在提交后的第74天完成。电子图书馆需要108天,而科学公共图书馆综合图书馆需要117天。相比之下,《细胞》杂志的评论时间为127天,《自然》杂志为173天,《科学与医学公共图书馆》杂志为177天,《发育细胞》杂志是最慢的生物医学期刊,需要194天。

关于对价的预印本

对生物学家来说,加快论文发表的一个方法是采用预印本。德国马尔堡大学的理论物理学家,《物理评论》的助理编辑布鲁诺·埃克哈特说,预印版本使得研究结果很快受到欢迎和批评。一份预先打印好的拷贝提交给了纽约冷泉港实验室运营的服务器BiorXIV,该拷贝在24小时内在线发布,并带有数字对象标识(DOI)。随后的修改是有时间标记的,任何人都可以阅读和评论文章。更重要的是,支持者认为,预印本的出版可以加入到传统的出版过程中。例如,2012年启动的F1000Research,通过首先发表论文,然后邀请公众同行评审和修改来实现这一点。

一些科学家走得更远,正在利用各种平台公布他们研究中随时出现的每一个假设、数据集或图表。每个文件都可以分配一个DOI,这样就可以被引用和跟踪。Himmelstein以预印本的形式发表了这篇论文,并逐渐撰写和发表了自2015年1月以来使用Thinklab平台启动的一个新项目的成果。

然而,预印本和实时数字出版平台并不是万灵药。沃斯威尔说,许多生物学家对预印本感到“害怕”,因为他们担心他们的结果会首先被竞争对手公布,或者他们会因为提出一个想法而失去信誉和知识产权。即使预印本出版后,科学家们仍会发现自己忙于同行评议,并寻找影响力大的期刊来寻求论文的最终发表,从而为他们的简历增光添彩。沃斯说,科学界依靠传统期刊充当“声望过滤器”,从而使重要论文吸引读者的注意力。没有他们,“我们如何找到好东西?”

经过近两年的等待,这篇论文最终发表在公共科学图书馆综合版上,弗雷泽得到了积极的回应。这篇文章被浏览了近2000次,下载了280次。该出版物还帮助她保住了目前在史密森学会自然历史博物馆担任博士后研究员的职位。

然而,弗雷泽不想再经历整个过程。因此,目前,她更倾向于将论文提交给中等规模的期刊,这些期刊可能会立即公布她的研究结果。“如果我的最终目标是找到一份教职员工的工作,我不能等两年才拿到论文。”(宗华)

《中国科学报》(2016-02-25,第三版国际版)

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