快速识别病毒和细菌新方法有了

图片来源:中国科学院物理研究所

病毒感染和AMR相关的细菌感染可以通过筛查患者样本中的DNA来检测。然而，这种方法非常具有挑战性，因为病毒DNA的数量非常少，并且在检测环境中不可避免地存在其他非病毒DNA。

因此，迫切需要提高现有检测方法的灵敏度，设计一种简单可靠的检测靶DNA的方案。

一般来说，标准的方法是设计一种分子探针，它能与病毒DNA紧密结合，但不能与非病毒DNA紧密结合。中国科学院物理研究所/北京国家凝聚态物理研究中心的研究人员和合作者已经展示了如何通过计算机模拟更好地做到这一点。

其基本思想是，与其设计与靶DNA特定位置牢固结合的分子探针，不如反直觉地设计能与整个靶DNA弱结合的探针，并利用超选择性概念实现探针与靶DNA的选择性多价结合。

为此，作者提出了一种识别最佳探针序列的数值方案，并在大规模粗化模拟中验证了该方法。仿真结果表明，所设计的探针确实能更有效地区分病毒和细菌的基因组，甚至能区分两种不同的大肠杆菌。

这项研究为开发合理且经济有效的传染病检测方法开辟了新的可能性。鉴于对快速可靠的疾病检测方法的迫切需求，研究结果有望产生更大的影响并刺激相关的实验工作，从而开发新的保健品。

最近，相关结果发表在《美国国家科学院院刊》上。这项研究得到了中国国家自然科学基金的支持。

相关论文信息:https://doi.org/10.1073/pnas.1918274117