众包个体基因数据库缓慢发展
来源:蒂莫西·李
计算遗传学家亚尼夫·埃尔里奇因建立了世界上最大的“家谱”而引起了人们的注意。目前,他的DNA.land引发了新一轮的个人基因数据库“众包热”。
早在2013年,Erlich的团队就发表了一篇关于如何利用公共资源通过交叉比较来确定基因研究参与者的个人身份的论文。
以前的研究发现,匿名遗传信息“留在”各种数据库中,将揭示他们的真实身份信息,只需要将这些数据与个人的DNA进行比较。此外,埃尔里奇发现连接互联网就足够了。之后,研究小组还将1300万人的谱系信息整合到一个家谱中。
去年,哥伦比亚大学的埃尔里奇和他的合作者乔·皮克雷尔邀请在23andMe和Ancestry.com以及其他商业基因公司中测试过DNA的人分享他们的DNA报告用于研究。埃尔里奇提到,“DNA.land”将收集300万名发送唾液样本进行测试的参与者的基因数据。
与企业不同,DNA.land将获得参与者的同意,并向研究人员公开他们的个人信息。这个月,DNA.land有32,000名注册参与者。埃尔里奇最近在美国人类遗传学年会上报告了他的研究结果,他说,尽管人口不到100万,但他仍然相信这个项目正在进行中,并且已经进入了一个新的领域。
“我认为,与试图众包DNA或人类材料的其他项目相比,我们已经取得了很多成功。你需要时间来建立动力。”埃尔里奇说。目前,DNA.land的数据已经用于研究,他的团队已经发表了一篇基于MinION测序的bioRxiv论文。“我们用DNA土地作为扫描大群体的一种方法,来确定像我或乔这样的个体是否可以被识别。”埃尔里奇说。
接下来,Erlich计划探索众包人们的脸书文件的可能性。一般来说,获得外表(如性格等)比较困难。)。在发表在《美国国家科学院院刊》上的一项研究中,研究人员可以根据你的偏好获得你的五种性格特征。(张张)
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