南通大学研究人员受访谈“NgAgo”新文章
“我们使用NgAgo技术,不是为了重复或验证它,而是将它作为一种工具来建立斑马鱼基因敲除模型。”
11月13日,记者联系了南通大学神经发生重点实验室副教授刘东。他在电话的另一端强调了这句话。
11日,在《自然》杂志的副刊《细胞研究》的新一期上,刘东作为记者发表了一篇论文,报道了将NgAgo基因技术应用于斑马鱼的研究结果。那天晚上,这个消息传遍了全国所有主要的学术界。"第二天早上,我起床后发现我的手机里充满了新闻。"
为什么报纸会引起如此大的反响?业内人士告诉记者,虽然它刊登在《自然》杂志的副刊上,但这种轰动效应从未出现过。唯一的原因是刘东采用了NgAgo基因技术,这一点受到学术界的广泛质疑。这是自韩春雨以来中国研究者发表的第二篇关于NgAgo基因技术的学术论文。
今年5月,河北科技大学的韩春雨团队在《自然》杂志的副刊《自然生物技术》上首次发表了一篇关于NgAgo基因技术的论文,引起了全世界的轰动。但后来,国内外许多学者公开表示,他们不能重复论文中描述的实验,从而引起争议。
“各种媒体甚至许多外国杂志来找我,要求我发表我对韩春雨和NgAgo技术的评论。这确实是一个困扰我们的问题。”刘东说,客观地说,从学术角度来评价是不可能的,“我们使用了不同的系统,没有重复他的实验。我们只使用了一种蛋白质NgAgo,我们无法进行任何联系或讨论。”
刘东告诉《每日科学》记者,他主要从事血管生成的研究,而“利用各种基因操作技术建立斑马鱼转基因和基因敲除模型”在实验室主页上介绍自己的研究领域排名第三,也就是说,这只是他的“副业”——利用这些模型来研究血管生成。
在这篇发表的论文中,刘东敲除的基因是fabp11a,它导致斑马鱼的眼睛发育缺陷。"这与血管生成没有直接关系."他马上告诉了记者。
但是在实验开始的时候,刘东真的想用NgAgo技术来敲除基因,而不是敲除它们。敲除和敲除是两个完全不同的学术概念,尽管它们只有一个词的区别。
基因敲除是去除不需要的基因,使目标基因表达并永久沉默。然而,基因敲除保留了靶基因,只阻断了靶基因的表达,但基因表达仍可在下一代生物中进行。敲除是基因编辑的功能之一,而敲除不是。
在5月份开始的实验中,刘东想要完成的基因敲除没有实现,但是基因敲除的结果出乎意料地获得了。为了保证实验结果的准确性,整个实验持续了5个多月,直到论文提交。
他们发现NgAgo的存在导致30%的斑马鱼胚胎发育成眼睛畸形,但这不是基因编辑的结果。测序显示,fabp11a基因无变化,但fabp11a基因的相对表达量下降了约50%。Fabp11a没有被编辑,但被删除了。
NgAgo下调fabp11a基因表达是意外吗?为了验证这一点,研究人员测试了斑马鱼的另外四个基因。结果表明,NgAgo可以达到击倒效果。因此,他们得出结论,NgAgo的击倒效应是普遍的。
“从实验来看,NgAgo的基因敲除效率高于传统方法。”刘东说,但他也补充说,这种观点不是很严格,毕竟,测试的基因数量很少,方法也不是很系统。
然而,刘东非常肯定地说,基因编辑功能在NgAgo中没有重复。“我们认为gDNA/NgAgo为斑马鱼基因敲除提供了一种替代方法。”在报纸上,刘东和他的伙伴这样写道。
关于NgAgo技术是否会在未来的实验中继续被研究和观察,刘东说:“这不是我的主要研究方向和兴趣,进一步的研究是否还不确定。”(南京,11月13日,《科技日报》)
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