艾伦干细胞浏览器首次在线发布

《科学技术日报》北京4月6日电(记者聂翠蓉)美国艾伦细胞科学研究所制作了一个为期一年的同一母细胞不同干细胞的3D照片集，并于5日以“艾伦干细胞浏览器”的名义在网上正式发布。这些公开的照片集将帮助研究人员预测与癌症和其他疾病相关的细胞结构变化，并加速干细胞、癌症和药物开发的研究进程。

艾伦干细胞浏览器采用深度学习分析算法和基因编辑工具CRISPR-Cas9制作而成。它包含了6000多张诱导多能干细胞的图片。每张图片中的重要结构，如DNA、细胞膜和线粒体都标有不同的颜色。

根据《自然》杂志网站上的一份报告，一年前，艾伦细胞科学研究所所长里克·哈弗兹(Rick Havez)带领一个团队对成人皮肤细胞进行了重新编程，以获得未分化状态的胚胎多能干细胞，并引入了荧光标记和基因编辑工具CRISPR-Cas9，使编码细胞运动和维持细胞形状的肌动蛋白基因发出特定的荧光。结果表明，这些来自同一皮肤细胞的干细胞具有完全不同的线粒体、肌动蛋白纤维和其他重要成分的位置、形状和数量。

研究小组中的计算机科学家使用深度学习程序分析了数千张图片，发现了不同细胞结构之间的相关性。深度学习程序可以通过一两条线索来推断细胞的结构信息，并与真实的细胞信息进行比较，不断学习和完善，从而演变成一种精确预测疾病相关基因变异的三维互动工具。

贝尔德研究所的计算机生物学家阿维·雷吉夫参与了人类细胞图谱的研究，他认为艾伦干细胞浏览器填补了细胞研究的空白，为研究人员理解同源干细胞的结构差异提供了新的工具。哈维斯的团队将在接下来的几个月里继续补充这些照片，包括处于不同分裂阶段的干细胞和细胞类型，如心脏和肾脏细胞，以进一步改进浏览器。