温室白粉虱染色体水平基因组图谱组装成功

温室白粉虱染色体水平基因组蔬菜的定位

最近，分子生态资源在网上公布了农业害虫烟粉虱的染色体水平基因组图谱。

这项工作是由中国农业科学院蔬菜与花卉研究所(以下简称研究所)的蔬菜病虫害防治创新团队与美国康奈尔大学的BTI合作完成的。他们揭示了温室白粉虱发育特异性表达和抗药性的分子机制。该研究对粉虱功能基因组学、植物-昆虫-微生物和病毒相互作用的进一步研究以及粉虱害虫抗性治理的应用具有重要意义。

该论文的第一作者、蔬菜研究所副研究员谢文说，温室粉虱和烟粉虱是世界上分布最广、危害最严重的两种粉虱害虫。2016年和2017年双方共同分析完成了烟粉虱基因组，但温室白粉虱基因组仍未确定。

在最新的研究中，他们利用Pacbio长读取和三代测序平台Hi-C技术，实现了白粉虱基因组的染色体级组装，组装大小为787兆字节和11条染色体。注意18，275个蛋白质编码基因，基因组中有56.6%的重复序列。

通过对粉虱发育阶段特异性表达的分析，发现了一些与粉虱化蛹和羽化有关的基因，如卵黄蛋白基因和表皮基因。

此外，烟粉虱和烟粉虱之间的进化分化远远大于不同生物型之间的进化分化。烟粉虱和烟粉虱的比较基因组表明，天冬氨酰蛋白酶家族在烟粉虱中显著扩增，这可能与烟粉虱特有的寄主选择性有关。通过对细胞色素P450家族的比较分析，研究人员发现了4个与烟粉虱CYPCM1同源的P450基因，这将有助于筛选被烟粉虱代谢的新烟碱类化合物。

相关论文信息:https://doi.org/10.1111/1755-0998.13159