科学家深入研究土壤多样性

微生物群落(包括细菌、单细胞生物和线虫)揭示了大量关于土壤状态的信息。在世界范围内，人们已经在基因水平上对这种生物多样性进行了大量的研究，但是数据库中记录的信息质量不同，这限制了进一步的研究。德国亥姆霍兹环境研究中心(UFZ)的研究人员现在已经建立了一个新的元数据数据库，包含15，000多个数据集。该结果最近发表在《核酸研究》杂志上。

目前，在微生物学家可以存档研究数据的两个最重要的数据库中，可以找到超过202，000个元基因组:微球蛋白-Rast和SRA。虽然数据是共享的，但数据集往往是不完整的，没有统一的标记和其他因素，给研究带来了很多麻烦。负责这项研究的UFZ微生物生态学家乌利塞斯·努内斯·达罗沙说:“这使得感兴趣的用户更难进一步处理数据。”

罗查的团队现在已经从全球陆地环境中的研究人员收集的毫克-拉斯和SRA数据集中筛选出宏基因组数据。他们筛选了从海洋中收集的数据。此外，来自84个国家的森林、草原或底土的15 022个宏基因组数据集被纳入新的元数据数据库。

研究人员表示，他们没有为准确的元数据描述建立任何新的科学标准，例如地理坐标、酸碱度或温度，而是使用现有的标准化方法。

元数据库TerrestrialMetagenomeDB已上线。用户最初可以用6个关键字搜索数据库，例如生物群落的起源、样本类型或数据源，如果需要，他们还可以用另外33个关键字跟踪更具体的数据。

此外，西班牙塞维利亚大学的研究人员证实了一种从未被描述过的土壤自然过程。研究人员已经证明，一些土壤矿物质可以通过可见辐射和紫外线将氮氧化物转化为硝酸盐。相关论文最近发表在《普通环境科学》上。

土壤中的氮对全球可持续性非常重要。尽管人们对自然界氮循环的基本过程已经了解了100多年，但研究人员提出了一些迄今未知的光催化机理:太阳辐射(尤其是紫外线)可以活化土壤中的矿物质，产生活性氧(*基)，从而将氮氧化物气体转化为硝酸盐，反之亦然。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/nar/gkz994

https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2019.134982