新冠病毒或与“近亲”差异更大并有两亚型

资料来源:美国疾病预防控制中心

中国科学院上海巴斯德研究所和北京大学的研究人员联合分析了这种新冠状病毒的起源和持续进化。研究发现，尽管基因组分析显示新的冠状病毒最接近云南菊头蝠携带的鼠13，但中性位点的差异比以前的知识高得多，并且新的冠状病毒分化为两种亚型。相关论文发表在3月3日的《国家科学评论》上。

研究人员调查了新冠状病毒和其他相关冠状病毒之间的分子差异程度。结果显示，尽管新冠状病毒和蝙蝠传染性非典型肺炎相关冠状病毒(鼠13)之间的基因组核苷酸只有4%的差异，但两种病毒之间中性位点的差异为17%，表明两种病毒之间的差异比先前估计的大得多。

本研究结果表明，新冠状病毒和穿山甲非典型肺炎冠状病毒的穗蛋白受体结合结构域功能位点的新突变可能是由突变和自然选择以及重组引起的。

研究人员还对103个新冠状病毒基因组进行了群体遗传分析。研究人员发现，在这些病毒株中已经出现了149个突变点，并且大多数衍生的突变是单基因突变，这表明它们要么是新近发生的，要么是人口增长的结果。

此外，新的冠状病毒可能已经进化成两种主要的亚型——L型和S型，这两种亚型由两种不同的单核苷酸多态性(SNP)明确定义，这表明迄今为止已经测序的病毒株之间几乎存在完全的联系。

虽然L型(约70%)比S型(约30%)更常见，但研究人员发现S型是原始版本。尽管L型在武汉新关肺炎爆发的早期更为普遍，但在2020年1月初之后，L型的频率有所下降。

研究人员推测，人类的干预可能会对L型病毒施加更大的选择压力，因为L型病毒可能更具攻击性，传播更快。另一方面，S型具有较长的进化时间和较弱的攻击性，这可能由于相对较弱的选择压力而增加相对频率。

专家认为，这些发现表明，有必要对新感染冠状病毒者的临床症状、基因组数据和流行病学数据进行进一步、立即和全面的研究。

相关论文信息:https://doi.org/10.1093/nsr/nwaa036