科学家提出核酸与小分子识别理论计算方法

中国科学院长春应用化学研究所研究员王锦和国家电子分析化学重点实验室副研究员闫志强提出了核酸-小分子识别特异性的理论计算方法，并开发了新的核酸-小分子相互作用能的评分函数SPA-LN。最近，研究结果发表在《核酸研究》上。

研究表明，核酸(包括脱氧核糖核酸和核糖核酸)不仅是储存和传递遗传信息的载体，而且还参与和调节细胞中的各种生命活动。功能性核酸如核酸开关、核糖核酸酶和非编码核糖核酸被认为是潜在的药物分子靶标。在筛选和设计新药时，预期的效果是新药可以有效地与靶核酸特异性结合，同时与其他核酸或其他生物分子(如蛋白质)的相互作用尽可能小，从而避免副作用。如何量化核酸的特异性和小分子识别是当前研究的难点。

王锦和颜志强基于漏斗能量地貌学理论，提出了一种具体的理论计算方法，可以有效区分具体复杂结构和非具体结构。根据核酸和小分子的识别系统，在特异性定量的基础上，开发了一套全新的核酸-小分子相互作用评分函数SPA-LN，改进了传统的核酸-小分子相互作用评分函数开发方法，提高了核酸与小分子相互作用预测的准确性。SPA-LN可广泛应用于以核酸为靶点的分子对接和药物分子设计与筛选。