出版商尝试让科学家为在线文章写评论

宣布在线研究论文甚至可以改变论文的写作、同行评议和出版方式。

双胞胎项目地图

如果该软件允许科学家在网上发表评论，他们是否愿意在网上发表评论、修订或评论？非营利组织“假设”的创始人丹·威利认为科学家会这样做。

威利的公司已经建立了一个开放的软件平台，允许用户识别文本或注释网页和PDF文件。2015年12月1日，公司宣布与40多家出版商、技术公司和学术网站合作，包括韦利出版社、美国公共科学图书馆、跨库搜索交叉参考(CrossRef)和预印文章的arXiv。

威利希望这种合作将鼓励研究人员开始注释全球在线学术材料。科学家可以对研究论文发表评论，并公开或私下分享这些注释，教育者可以在课堂上使用这些注释进行互动。如果这个想法能够实现，一些热心人士说，注释在线研究论文甚至可以改变论文的写作、同行评议和出版的方式。2011年，在一个慈善基金的支持下，抵押权基金会在加州旧金山成立。该公司有一个雄心勃勃的目标:“让世界交流知识。”

在线注释

在线标注的概念是在网站开始时提出的。自1993年以来，允许网络读者对在线文本进行注释的想法就一直存在，早期的马赛克浏览器(世界上最早的能够显示图片的浏览器)就有这种功能。然而，这一功能最终被放弃了。如今，很少有网站默认允许读者对自己的网页发表评论，其中包括一个博客平台Medium，一个学术参考管理系统F1000 Workspace和一个新网站Quartz，也有这种功能。然而，这些评论只能被上述网站的用户看到。其他注释服务网站，如美国国家在线或谷歌文档，要求用户在共享注释和评论之前将数据上传到云服务器。

Hypothes.is并不是唯一一个希望用户轻松注释整个页面的服务网站。另一个名为Genius的网络注释服务器也可以注释说唱音乐。去年4月，该网站推出了浏览器插件目录等服务，帮助用户注释任何网页。然而，与假设不同的是，天才的代码不是开源的，它的服务与PDF文件不兼容，也不适用于学术界。在学术领域，参考管理工具ReadCube使在线读者能够注释PDF文档，但该软件是私有的。

相比之下，Physis平台的开源特性意味着任何人都可以使用它来创建注释，就像人们使用标准技术来创建他们的网页一样。该公司也是万维网联盟的成员，万维网联盟是一个网络标准机构，负责设置注释标准和它们的通信方式。该网站希望允许注释的页面能够采用相同的标准和原则，使该功能便于使用和交互。工作组已经发布了其标准的草案，预计将在2016年底完成。

操作方式

现在，抵押权的用户有几个选项来创建和查看评论。这些选项包括浏览器书签、浏览器工具栏，或者在任何统一资源定位器的开头添加“via . hypot is . is/”。

当一个用户打开一个网页，比如一篇学术文章，网络浏览器会显示用户能看到的任何注释。那些表达高度强调的单词和注释将出现在文本的顶部。用户可以在此基础上添加自己的评论，就像学生在课本上做标记一样。系统将默认这些评论是公开的，但是它们也可以被选择为封闭的个人评论。去年11月3日系统升级后，评论也可以在私人团体之间分享。这将允许这些工具在期刊俱乐部、课堂培训甚至同行评议中使用。

如果网页在注释完成后发生变化，软件将使用“模糊控制”逻辑将注释与原始文本中的近似值进行匹配。该系统还可以用来标记从超文本标记语言到PDF的转换过程，反之亦然。

相关评论存储在抵押权信息系统的服务器上。Whaley说，2015年，该服务器记录了大约250，000条评论和来自大约10，000名用户的评论。例如，在2015年10月帕特里那飓风发生后，气候学家在mashable.com的网站上对许多开放获取的文章进行了广泛的评论。威利补充说，如果出版商想自己处理评论，或者如果公司想对评论保密，他们可以通过同一个软件平台管理自己的服务器。

伙伴

现在，“假设”的用户已经能够注释任何网页——包括他们能看到的研究论文和付费阅读文章。最近宣布的官方合作见证了一些出版商鼓励研究人员进行在线注释的努力，包括处理一些让注释系统出错的内容，如网页和嵌入式书籍。

例如，JSTOR数字图书馆正在开发一个由Physis . IS定制的工具，并将其应用于伊利诺伊州芝加哥市的文学组织和出版商国家诗歌基金会的教育项目。纽约JSTOR实验室主任亚历克斯·汉弗莱斯(Alex Humphreys)说，老师们可以在课堂上用这个工具来注释诗歌。他们可以选择要注释的诗歌，然后使用副本创建一个特殊的页面，并限制只有类才能看到这些注释。学生也可以创建个人评论并在小组中分享。汉弗莱斯说这个工具就要出现在舞台上了。

英国剑桥大学的科学出版商ELife公司的技术总监Ian Mulvany说，该公司还测试了用Physis . is代替同行评审系统的可行性。ELife计划将重新设计的系统与评论平台合并，以取代目前的评论系统Disqus。马尔瓦尼说，至少“假设”为多目标评论提供了一种机制，这相当于将评论从网页底部移到文章的主体。

另一个合作伙伴是由纽约康奈尔大学图书馆管理的arXiv预印文章库，该图书馆一直在研究如何在多个不同的文章版本中进行注释，信息科学家、arXiv技术研发部门主管西蒙·华纳(Simeon Warner)表示。

不仅仅是“涂鸦”

假设公司计划采取措施改进其平台，包括通过整合研究人员独特的ORCID(开放研究人员和作者用户身份)数字文件来验证审查者的身份。通过促进科学家对已发表文件的评论并过滤掉不必要的空白区域，这将在学术界使用该系统方面向前迈出一大步。保罗·金斯伯格是arXiv的创始人，也是康奈尔大学的物理学家，他说:“如果人们开始阅读文章，他们会看到类似涂鸦的评论，然后关掉它们。因此，他们的实验可能会失败。”

该团队成员、澳大利亚珀斯柯廷大学文化与技术中心成员卡梅伦·耐伦说，如果这项措施得以实施，在线注释将代表学术交流方式的一个根本性变化。奈伦解释说，目前的学术出版过程经常需要将文件从一个地方转移到另一个地方。研究人员准备手稿，与同事分享，添加评论，并提交给出版商。期刊编辑将副本发送给同行评审的研究人员进行评审，并将他们的评论返回给作者。然后作者反复与杂志的编辑沟通，直到最后的草稿被修改。文章发表后，读者会发表评论。

奈伦说，在开源注释平台上，文章是关注的焦点。随着时间的发展，评论会越来越多。不同的贡献者可以通过改变谁有权查看文章和评论来管理内容。“你可能会认为这是一种结构，允许这些评论在不同的时间和版本中*移动，这是我们以前从未做过的。”他说。

但金斯伯格指出，尚不清楚研究人员是否愿意在网上发表评论，即使技术允许他们对评论保密或分组分享。"目前，科学家仍然没有动力在网上广泛发表评论."他说，“这也是一个需要进行的实验。”(红枫)

中国科学新闻(2016-006第三版国际版)

阅读更多

《自然》杂志的相关报道