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曹晓风

科普小知识2022-09-13 11:47:14
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曹晓风,女,1965年出生于中国北京,1988年毕业于北京大学,1991年获中国农业大学硕士,1997年获得北京大学博士。遗传生物学家。中国科学院遗传与发育研究所研究员,博士生导师。现任中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员,植物基因组学国家重点实验室副主任,国际植物表观遗传学专家委员会委员,《中国科学》副主编、CurrentOpinioninPlantBiology和ThePlantCell等杂志编委。

姓名:曹晓风

性别:女

生日:1965年

籍贯:北京

国籍:中国

民族:汉族

政治面貌:中*员

现任职务:中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员,植物基因组学国家重点实验室副主任,国际植物表观遗传学专家委员会委员

毕业院校:北京大学

学历学位:博士

入党时间:1987年

1、人物简介


曹晓风

曹晓风,女,1965年出生于中国北京,1988年毕业于北京大学,1991年获中国农业大学硕士,1997年获得北京大学博士。遗传生物学家。中国科学院遗传与发育研究所研究员,博士生导师。

主要从事植物基因组学相关研究,现任中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员,植物基因组学国家重点实验室副主任,国际植物表观遗传学专家委员会委员,《中国科学》副主编、CurrentOpinioninPlantBiology和ThePlantCell等杂志编委;先后获得美国“杜邦青年科学家奖”和“中国青年女科学家奖”等称号。2015年12月7日,当选中国科学院院士。

2016年6月12日,农业部向社会公示了第五届农业转基因生物安全委员会委员名单,曹晓风为国家农业转基因生物安全委员成员。

2016年11月,当选为发展中国家科学院院士。

2、人物经历

1984-1988北京大学生物系学士

1988-1991中国农业大学生物学院硕士

1993-1997北京大学生命科学学院博士

1991-1993北京大学生命科学学院助教

1993-1997北京大学生命科学学院讲师

1995-1996英国JohnInnesCentre访问学者

1997-1998美国华盛顿州立大学生化研究所博士后

1999-2003美国加州大学洛杉矶分校助理研究员

2003-今中科院遗传与发育生物学研究所研究员

2015年12月7日,当选中国科学院院士。

2016年6月12日,当选第五届农业转基因生物安全委员会委员。

2016年11月,当选为发展中国家科学院院士。

2017年10月,当选中国科学院留学人员联谊会(中国科学院欧美同学会)第一届理事会副会长。

3、人物荣誉

2002年入选中科院“百人计划”

2003年获国家杰出青年基金

2006年“百人计划”终期评估中获得优秀

2008年获得美国杜邦青年科学家奖

4、研究领域

表观遗传学(Epigenetics)指的是研究基因功能的变化,这种变化在有丝分裂和/或减数分裂中是可以遗传的,与一般遗传学不同的是,所研究的基因不存在DNA序列上的改变。从广义上讲,表观遗传学控制基因功能主要包括以下三个方面:基因本身的DNA甲基化;基因所在的核小体上的组蛋白的共价修饰、染色质核小体的重塑和核小体变种以及发现的小分子RNA介导的转录和转录后水平的基因沉默。随着表观遗传调控机理研究的深入和相关研究技术的突破,在基因组水平上研究各种植物、不同发育阶段和各种生长条件的表观遗传图谱的表观遗传组学正在蓬勃兴起,为揭示高等植物生长发育的分子机理提供了新手段和新思路。


曹晓风

她所在的实验室运用拟南芥和水稻为材料,研究组蛋白修饰以及小的非编码RNA如何影响基因表达以及植物发育,主要研究方向为组蛋白甲基化对拟南芥开花时间的调控和水稻小RNA合成调控及其对植物发育的机理研究。

1、拟南芥中的组蛋白甲基化与开花时间调控的分子机理研究

在真核生物的细胞核中,许多细胞生理活动都以染色体为模板来进行。作为染色体的组分之一,组蛋白延伸出来的N末端可以发生多种翻译后修饰,这些修饰的不同组合构成了在DNA序列之外的另一个层面上的遗传信息并发挥着重要功能。在动物中,人们鉴定了一些催化组蛋白甲基化与去甲基化过程的酶,编码这些酶的基因分属于几个重要的基因家族。组蛋白甲基化是组蛋白修饰当中最为重要也是最为复杂的一种修饰。对组蛋白H3、H4上赖氨酸残基甲基化的进一步研究证明,组蛋白甲基化在维持染色体功能以及各种细胞生理活动的调控过程中发挥着重要作用,其中包括对染色体结构和基因表达的调节、异染色质的形成、基因印记、基因组稳定性和其他重要的细胞生理活动。另外,精氨酸的甲基化和去甲基化的重要作用也逐渐被证明,研究表明,精氨酸甲基化参与了转录调控、RNA加工、核运输、DNA损伤的响应以及信号转导等过程。研究中发现了一大类赖氨酸和精氨酸去甲基化酶,这些酶都含有一个保守的JmjC结构域。甲基化的动态平衡是通过对甲基化和去甲基化这两个过程的控制来实现的。在拟南芥的基因组中存在着许多含有SET结构域的蛋白、蛋白质精氨酸甲基转移酶以及含有JmjC结构域的蛋白。我们通过生物化学和反向遗传学的手段鉴定出了一些新的组蛋白甲基转移酶和去甲基化酶,并试图借此来理解组蛋白甲基化在植物发育过程中所发挥的重要作用。

开花时间对于植物是非常重要的,植物通过响应外源环境和内源的信号,在合适的时间开花,才能尽可能成功地繁殖后代。研究已经证实,植物开花时间受光周期通路、赤霉素(GA)通路、春化通路和自主通路的调控。已有研究表明,包括乙酰化、赖氨酸甲基化和泛素化在内的组蛋白修饰在植物开花时间的调控中发挥着重要作用。在拟南芥中,蛋白质精氨酸甲基化作为一种翻译后修饰,也参与了植物开花时间的调控。我们之前的工作已经证实在拟南芥中,AtPRMT5(proteinargininemethyltransferase)、AtPRMT10、AtPRMT4a/4b以及AtHAC1(histoneacetyltransferase)通过抑制FLC的表达促进开花。她所在的实验室研究的主要方向之一是研究组蛋白修饰的重要因子在调控拟南芥开花时间中的分子机理。

2、高等植物中smallRNA的合成途径调控机理研究

RNA沉默在植物发育过程中的作用是基因组学研究关注的焦点。miRNA和siRNA是两类具有调节功能的RNA小分子,在发育调控、基因组稳定性和病毒防御方面发挥重要作用。miRNA和siRNA很相似,但其起源、形成过程不同。DICER或者DICER-LIKE(DCL)在miRNA和siRNA生物合成途径中发挥关键作用,小分子RNA成熟后会整合到不同的RISC复合体(RNA-InducedSilencingComplexes)中发挥作用。

水稻(OryzasativaL.)作为世界上最重要的农作物之一,是进行单子叶植物基因组学和分子生物学研究的模式物种。水稻中存在多个DCL蛋白,其功能在单双子叶植物分化之前就已经分化。本研究组以水稻为模式生物,重点研究水稻小分子RNA的合成途径,期望阐释smallRNA在水稻发育过程中的调控网络。

她所在的研究组从水稻中鉴定了一批新的miRNA,如OsmiR528,OsmiR529和OsmiR530等;获得了OsDCL1IR和OsDCL4IR两个功能缺失突变体,证明OsDCL1和OsDCL4在水稻发育过程中发挥重要作用。进一步研究发现,OsDCL1对miRNA的累积起主要作用;OsDCL4主要负责对21ntsiRNA进行加工。研究组的长期研究目标之一是以水稻为模式生物,深入研究smallRNA合成途径的分子机理和小分子RNA在水稻发育过程中的重要作用。

5、发表论文

PedroCrevillén,HongchunYang,XiaCui,MichaelGreeff,MartinTrick,QiQiu,XiaofengCao,andCarolineDean.Epigeneticreprogrammingpreventingtransgenerationalinheritanceofthevernalizedstate.Nature,doi:10.1038/nature13722(2014)

HaiZhou,MingZhou,YuanzhuYang,JingLi,LiyaZhu,DagangJiang,JingfangDong,QinjianLiu,LianfengGu,LingyanZhou,MingjiFeng,PengQin,XiaochunHu,ChengliSong,JinfengShi,XianweiSong,ErdongNi,XiaojinWu,QiyunDeng,ZhenlanLiu,MingshengChen,Yao-GuangLiu,XiaofengCao*,andChuxiongZhuang*.RNaseZprocessesUbL40mRNAsandcontrolsthermo-sensitivegenicmalesterilityinrice.NatureCommunications,DOI:10.1038/ncomms5884(2014)

LuluWang,XianweiSong,LiangfengGu,XinLi,ShouyunCao,ChengcaiChu,XiaCui,XuemeiChenandXiaofengCao*.NOT2proteinspromotepolymeraseII-dependenttranscriptionandinteractwithmultiplemiRNAbiogenesisfactorsinArabidopsis.ThePlantCell,25:2,715-727(2013).

ShengbenLi,LinLiu,XiaohongZhuang,YuYu,XigangLiu,XiaCui,LijuanJi,ZhiqiangPan,XiaofengCao,BeixinMo,FuchunZhang,NatashaRaikhel,LiwenJiang,andXuemeiChen.MicroRNAsinhibitthetranslationoftargetmRNAsontheendoplasmicreticuluminArabidopsis.Cell,153,562–574(2013).

KaiShu,HuaweiZhang,ShengfuWang,YaorongWu,SanyuanTang,ChunyanLiu,XiaofengCaoandQiXie.ABI4regulatesprimaryseeddormancybyregulatingthebiogenesisofabscisicacidandgibberellinsinArabidopsis.PLoSGenetics,9(6),e1003577(2013).

JixianZhai,YuanyuanZhao,StaceyA.Simon,ShengHuang,KatherinePetsch,SiwaretArikit,ManojPillay,LijuanJi,MengXie,XiaofengCao,BinYu,MarjaTimmermans,BingYang,XuemeiChenandBlakeC.Meyers.PlantMicroRNAsDisplayDifferential3’TruncationandTailingModificationsThatAreARGONAUTE1DependentandConservedAcrossSpecies.ThePlantCell,25:2417-2428(2013).

XianweiSong,DekaiWang,LijiaMa,ZhiyuChen,PingchuanLi,XiaCui,ChunyanLiu,ShouyunCao,ChengcaiChu,YuezhiTaoandXiaofengCao*.RiceRNA-dependentRNApolymerase6actsinsmallRNAbiogenesisandspikeletdevelopment.ThePlantJournal,71:378-389(2012).

TheEPICPlanningCommittee:FredBerger,XiaofengCao,VickiChandler,LizDennis,RobMartienssen,BlakeMeyers,CraigPikaard,JimPeacock,EricRichards,DorisWagner,DetlefWeigel,VincentColot,RogerDeal,CarolineDean,JoeEcker,MaryGehring,ZhizhongGong,BrianGregory,GutierrezRodrigo,JoseGutierrez-Marcos,MitsuyasuHasebe,Il-DooHwang,StevenE.Jacobsen,TetsujiKakutani,JiayangLi,ScottMichaels,Yoo-SunNoh,NickProvart,MattVaughn.ReadingtheSecondCode:Mappingepigenomestounderstandplantgrowth,development,andadaptationtotheenvironment.ThePlantCell,24:2257-2261(2012).

6、任免信息

2015年7月31日,入选中国科学院院士增选初步候选人名单。

2015年12月7日,当选中国科学院院士。

2016年11月,当选为发展中国家科学院院士。

2018年1月,中国人民政治协商会议第十三届全国委员会委员名单正式公布,共2158人,曹晓风在名单之列。

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