我国科学家发文还原新型冠状病毒发现始末
根据《中国医学杂志》英文版最新发表的网上论文,中国科学家已经共同完成了对新型冠状病毒病原体的发现和鉴定,这是国内期刊的首次发表。
2019年12月,武汉市出现多起不明原因肺炎病例。中国医学科学院的研究网络从一个从未报道过的病例中发现了一种冠状病毒,并获得了其全基因组序列,从而获得了导致武汉肺炎流行的第一种新型冠状病毒的全基因组序列。通过对整个病原体谱的分析,推测它可能是肺炎的“罪魁祸首”,很明显,它是一种感染人类的冠状病毒。相关发现立即报告给相关部门。随后,中国医学科学院与作为平行检测单位的中国疾病预防控制中心和中国军事科学院军事医学研究所共同完成了疫情的病原学确认。
中国医学科学院病原生物学研究所王健伟教授,与*医院曹斌教授、中国医学科学院病原生物学研究所祁进教授、秦川医学实验动物研究所、广州伟源基因技术有限公司、湖北省疾病预防控制中心、武汉市疾病预防控制中心、武汉市金印滩医院、同济医院、武汉市中心医院教授, 华中科技大学同济医学院附属完成了对武汉市5例不明原因重症肺炎患者病原学研究的病原体发现和鉴定。
据了解,2019年12月15日至29日有5名患者因高烧、咳嗽等症状入院。临床诊断为不明原因肺炎。患者病情进展迅速,4例出现急性呼吸窘迫综合征,1例死亡(61岁男性,合并慢性肝病和腹部粘液瘤),3例无已知基础疾病。
对于不明原因的肺炎病例,本研究基于患者的深肺样本——支气管肺泡灌洗液(BAL)。利用NGS测序技术从所有病例样本中获得大量与冠状病毒同源的核苷酸序列,并通过剪接获得病毒的全基因组序列。这些序列在大多数样品中检测到的微生物核苷酸序列中所占的比例最高,获得的5个病毒序列高度同源,相似性高达99.8% ~ 99.9%,而人类共生微生物/条件致病菌序列数据在深度测序数据中所占的比例相对较低。随后,从两个样品中成功分离出病毒。病毒的形态通过电子显微镜得到证实。根据血清学方法,所获得的病毒与患者康复期血清之间的抗原抗体反应得到确认。这些结果表明,这种病毒可能是一种致病病原体。
本研究进行的基因相似性分析表明,该病毒与GenBank数据库公开报道的非典冠状病毒的同源性为79%,该病毒与舟山地区2015年发现的两种菊头蝠携带的非典样冠状病毒株的核苷酸序列相似性最高,仅为87.6% ~ 87.7%,聚合酶基因与已知冠状病毒的相似性小于90%,是一种未知的新病毒。
新发现的菌株含有ORF3和完整的ORF8基因区,这是蝙蝠来源的冠状病毒的特征序列。系统发育分析显示,所获得的五个2019nCoV菌株的序列与蝙蝠的序列最接近,但形成了独立的进化分支。这些发现表明病毒可能源自蝙蝠。
据报道,严重急性呼吸综合征冠状病毒(非典冠状病毒)和中东呼吸综合征冠状病毒(中东呼吸综合征冠状病毒)从动物传播已导致世界上重大公共卫生事件。这一次新型冠状病毒的出现使我国传染病的预防和控制面临又一次考验。找出传染源,明确传播方式,确定疾病的临床特征和预后,掌握病毒变异趋势,是防控疫情取得胜利的关键。