犬类粪便遍及人类考古记录

狗，比如这只古罗马狗，可能在考古记录上留下了它们的“印记”。资料来源:PAUL WILLIAMS/ALAMY STOCK PHOTO

梅林达·泽德(Melinda Zeder)现在是史密森学会国家自然历史博物馆的考古学家，他永远不会忘记早期的考古经验。

1981年，当时还是研究生的泽德在伊朗西南部旧石器时代的一个洞穴里整理动物骨骼时，突然发现了一个不明碎片。

"当你分不清石头和骨头时，就把舌头放在上面。"佐德说如果碎片是骨头，它会粘在舌头上。佐德做到了，但碎片没有粘在舌头上，而是开始溶解。她非常困惑，向一位更有经验的同事寻求帮助。同事笑了:“那是鬣狗的粪便。”

这种古老的排泄物可以存留数千年而不被破坏。它甚至可以保持原来的形状和颜色。考古学家通常可以根据大小和其他属性来区分人类和动物的粪便。然而，事实证明，狗的粪便很难与人类区分开来，这可能会阻碍研究人员重建古人的饮食习惯。

哈佛大学分子考古学家克里斯蒂娜·沃林和他的同事开发了一种基于人工智能的工具，他们声称这种工具可以准确区分人类和狗的“古代排泄物”。经过几千年对十几个样本的分析，他们得出了一个惊人的结论:考古记录中充满了狗的粪便。

Warinner向世界各地的考古学家询问古代人类排泄物的样本，以研究在人类肠道中占最大比例的大量细菌是如何随时间变化并在人类排泄物中留下痕迹的。

然而，沃林对她收到的样本感到困惑:“我们认为这一定是人类排泄物，但我们得到的数据非常奇怪。”

因为有些人吃狗，人类远古的粪便可能含有狗的遗传物质；狗的粪便中也可能含有人类的DNA，因为狗有时会吃人类的粪便。然而，当沃林研究小组分析样本中的遗传物质(其中一些是粪便化石)时，发现有些样本含有大量犬科动物的DNA，而这些DNA只能来自犬科动物。

为了找到更好的方法来区分两者，沃林求助于她的研究生马克西姆·伯瑞，她正在德国马克斯·普朗克人类历史科学研究所攻读生物信息学博士学位。

博里从粪便样本中收集了所有的DNA，不仅包括人类和狗的遗传物质，还包括微生物、植物和宿主肠道中其他任何东西的基因序列。然后，他建立了一个机器学习程序来学习如何区分现代人和狗粪便样本中的大量数据。

研究人员将获得的名为coproID的程序应用于13个样本(从一个有7000年历史的中国农场回收的粪便到英格兰南部一个有400年历史的家庭的粪便)。他们还测试了七个对照样本(不含粪便但来自可能发现粪便的地方的沉积物，包括古代垃圾堆和人骨盆腔等)。)。

CoproID将所有对照样本归类为非粪便样本。沃林研究小组最近在皮耶日报道，他们还确认了7个样本的归属，其中5个是人类粪便，2个是犬类粪便。

最令人惊讶的发现之一是17世纪英国家庭的粪便样本。在20世纪80年代的一次翻新中，工人们在原来的屋顶附近发现了一个带有沉淀物的罐子。他们把它送到了当地的博物馆，并在那里展出了几十年。标签上写着“三个人的排泄物”，但coproID报告说，这些排泄物不是人的，而是一只狗的。

相关论文信息:https://doi.org/10.1126/science.abc2721