外切酶组合可为三维基因组学技术降噪

利用核酸外切酶组合降低三维基因组序列噪声的策略

最近，《核酸研究》杂志在线发布了中国农业科学院深圳农业基因组研究所(以下简称深圳基因组研究所)的最新成果。该研究所的动物功能基因组创新团队提出了一个新策略，通过使用核酸外切酶组合来降低三维基因组系列技术的噪音。

《通讯》作者、深圳基因组研究所研究员张玉波表示，染色质构象捕获技术(C- technology)近年来已广泛应用于三维基因组学。3C、4C、5C、高C等一系列C-技术应运而生，但普遍存在较高的数据噪声。

本研究筛选出一系列高效的核酸外切酶组合，可有效消除线性DNA中的噪声源和后续测序结果。在标准Hi-C中的验证表明，相邻连接系统中的有效交互模板的比率可以从大约40%增加到大约80%。该策略可以应用于不同的C-技术，有望有效降低技术噪声。

该研究由国家青年专项、国家自然科学基金、国家重点研发计划、中国农业科学院科技创新工程和大鹏新区资助。

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https://doi.org/10.1093/nar/gkaa106