科学家解析一种基因变异的致癌风险

《自然》杂志最近在网上发表的一篇论文更准确地根据功能对成千上万个BRCA1基因变体进行了分类。这些功能评分对于乳腺癌和卵巢癌风险的基因检测和解释具有临床意义。

BRCA1是人类肿瘤抑制基因。导致BRCA1丧失功能的突变与早发乳腺癌和卵巢癌的易感性相关。虽然已经发现了成千上万的BRCA1基因变异体，但其中许多被归类为“意义不明的变异体”，这给癌症风险评估带来了巨大的挑战。

找出这些未知突变的一种方法是检测突变基因的表达是否具有恢复DNA修复的功能，这也是肿瘤抑制过程的一部分。美国华盛顿大学的杰伊·谢尼弗和他的同事利用基因组编辑技术评估了对BRCA1基因功能至关重要的13个外显子的近4000个单核苷酸变异(SNV)的功能。随后在2000万人单倍体(HAP1)细胞中进行了细胞活力测试。

最后，研究人员确定了大约300种可以干扰表达的SNV和400多种错义突变(这可以导致蛋白质氨基酸序列的变化)，并发现这些突变没有实际功能(不破坏基因的原始功能)。这些功能评分与已知致病或良性变异的临床评估密切相关。

该小组指出，与其他细胞系相比，HAP1细胞系可能不是最好的生理模型，但与临床评价的高度相关性验证了数据。研究人员肯定了功能评分对突变分类的重要价值，并认为研究结果可直接应用于BRCA1基因筛选的解释。

(艺鹭)

相关论文:doi:10.1038/s 11586-018-046z

中国科学新闻(2018-09-17，第二版国际)